Seychelly nenabízejí jen bohatý svět rostlin a zvířat. Geologickou zvláštností jsou žulové ostrovy, které vznikají dvojím způsobem: ostrovy sopečného původy vznikly tak, že se sopka vztyčila nad hladinu moře. Korálové ostrovy se vytvořily tím, jak klesla hladina moře, tak se korálový útes dostal nad hladinu a odumřel. K nejznámějším korálovým ostrovům, z nichž málokterý přesáhne výšku 1 metru nad mořem, patří Maledivy.
Seychelly, které ční do výšky až 900 metrů, mají úplně jinou minulost. Vznikly před 200 miliony let, kdy se rozpadla Gondwana a vytvořily se Asie, Afrika a Jižní Amerika. Menší úlomky mezi východoafrickým pobřežím a Indií jsou Seychelly. Větší úlomky jsou dnešní ostrovy Madagaskar a Srí Lanka.