K národním parkům Seychel patří: atol Aldabra, ostrovy Aride, Cousin a Curieuse, Morne Seychellois na Mahé a Májové údolí (Valée de Mai) na Praslinu. Kromě údržby cest je v údolí každý zásah do přírody zakázaný.
Přírodně chráněné jsou i některé oblasti okolních moří. Aby zůstala alespoň částečně zachována jedinečná podvodní říše, nesmí se tu třeba zakotvit.
Obzvlášť zajímavé jsou 2 mořské národní parky.